鼠抗种型/类,亚类和鼠抗的分型
与人类一样,小鼠来源的抗体也有5种同种型抗体,分别为IgA, IgD, IgE, IgG, 和 IgM。每种同种型抗体都拥有不同的重链。种型亦被称为类,又因抗体亦被称为免疫球蛋白(immunoglobulin),所以Ig的后缀字母代表抗体的类或亚类。
鼠抗的类型(isotype),亚类(subclasses)和基因名称
每一条重链均有可变区和稳定区组成。虽然稳定区仅是免疫球蛋白重链的一部分,但是它已被命名为各种特异的基因。表1列出了鼠抗的类,亚类和基因名称,并链接到了NCBI 和 IMGT基因数据库。
类型 | 亚类 | NCBI基因 | IMGT基因 |
IgA |
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| |
IgD |
| ||
IgE |
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| |
IgG | IgG1 | ||
IgG2a | |||
IgG2b | |||
IgG2c | |||
IgG3 |
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IgM |
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表1:鼠抗的类,亚类和基因名称。
IgG2a 和 IgG2c 种型抗体:
具有等位基因Igh1-b的近交品系小鼠具有IgG2c种型抗体而不是IgG2a [1]。除其他种型抗体以外,鼠科动物的抗体重链只具有IgG2a 和 IgG2c二者之一。
来邦网抗体数据库-鼠抗种型
来邦网抗体数据库总结列举了来自100多家高质量抗体生产商的抗体产品。其中大多数商家生产提供鼠源的单克隆抗体。下面简单列举了不同种型的抗体。
IgA: CD19, CD36, Sm proteins
IgE: 卵清蛋白(ovalbumin), 二硝基苯酚(dinitrophenol), CD3
IgG1: c-Jun , IGF-II受体(IGF-II receptor), Toll样受体4(Toll样受体4/MD-2),
IgG2a: CD45.2, 弓形虫(Toxoplasma gondii), UBE2Q2
IgG2b: FAM3B, MARCH3, SMN2
IgG2c: CD209a
IgG3: 钙粘蛋白(cadherin), HSPA1A, 皮质醇(cortisol)
IgM: CD15, Piwi-like protein 2, defencin
人类,小鼠,大鼠,兔,和其他动物有不同的抗体同种型和亚类的基因组。
小鼠: IgA, IgD, IgE, IgG1, IgG2a, IgG2b, IgG2c, IgG3, IgM. 见上。
大鼠: IgA, IgD, IgE, IgG1, IgG2a, IgG2b, IgG2c, IgM for Norway rat
人类: IgA1, IgA1, IgD, IgE, IgG1, IgG2, IgG3, IgG4, IgM
兔:IgA1, IgA2, IgA3, IgA4, IgA5, IgA6, IgA7, IgA8, IgA9, IgA10, IgA11, IgA12, IgA13, IgA14, IgE, IgG,IgM
山羊:IgA, IgE, IgG1, IgG2, IgE, IgM
鸡: IgY
鼠抗种型的重要性
抗体的种型对于体内的免疫应答及其效应机制的发挥极其重要。鼠IgG抗体对于免疫球蛋白体内生物学功能的发挥也及其重要。不同种型的鼠IgG显示出不同的抗菌性(IgG3 >> IgG2b > IgG2a >> IgG1),并且当与脑膜炎奈瑟氏菌(Neisseria meningitidis)外膜蛋白PorA的P1.16表位抗原发生反应时,其调理吞噬性能也不尽相同(IgG3 > IgG2b = IgG2a >> IgG1)。 多数抗体使用人员看起来不太注重抗体的类和亚类,这在蛋白免疫印迹和免疫沉淀实验中确实无关紧要。但是在双标记实验和流式细胞实验中,遇到类似的关于二抗的问题,则必须考虑其类和亚类。(见来邦网 如何选择第二抗体)。
鼠抗的分型
利用特异的抗重链稳定区抗体进行酶联免疫吸附试验或流式细胞实验,并与适当的抗体种型进行对照,可以鉴定鼠抗的种型和亚类。众多不同的商家提供了形式多样的种型鉴定试剂盒。文献中引用zui多的种型鉴定试剂盒之一是AbDSerotec MMT1,见: 鼠抗的分型试剂盒.
鼠抗的分子量
一个免疫球蛋白分子具有两条重链和两条轻链。重链和轻链之间通过链内和链间的二硫键连接在一起。IgA, IgD, 和 IgG的重链都有一个由三个免疫球蛋白结构域组成的稳定区。例如,鼠IgA的重链稳定区有344个氨基酸(ENSMUSP00000137226);鼠IgG1稳定区有324个氨基酸 (ENSMUSP00000100216)。而其他种型的重链含有的免疫球蛋白结构域数目则可能有所不同,例如,分泌性膜结合抗体IgM重链稳定区包含两个免疫球蛋白结构域。(见 Uniprot P01881 and P01882). IgE 和 IgM的重链稳定区均由四个免疫球蛋白结构域组成。鼠的IgM重链稳定区则有475个氨基酸(ENSMUSP00000136807)。所有种型抗体的轻链的可变区都是由一个单独的免疫球蛋白结构域组成的。每个免疫球蛋白结构域大约有110个氨基酸。IgD和IgG的重链大约包含450个氨基酸,而IgE和IgM的重链包含约550个氨基酸。每条轻链(kappa 或lambda)都包含一个稳定的免疫球蛋白结构域和一个可变的免疫球蛋白结构域,其长度大约为211到217个氨基酸。通常IgG的分子量约为150KD。在减重的情况下,每条重链约为50KD,每条轻链约为25KD。人类的IgA2抗体,其重链和轻链之间没有二硫键相互连接。IgM分子间通常会经二硫键连接在一起,并倾向于以五聚体或六聚体的形式存在,因此其分子量可高达970KD。因为免疫球蛋白经常被糖基化,因此其分子量也是不同的。有时,与其名义上的分子量会相差很大。
鼠抗的生产
小鼠是单克隆抗体生产的主要宿主动物,同时也是多克隆抗体生产的宿主。截止到2012年12月6日,来邦网数据库列举的小鼠单克隆抗体可免疫21663种基因,鼠多克隆抗体可以免疫10387种基因。(见 鼠抗)。
抗鼠源基因的抗体
小鼠也是使用普遍的研究模型,也有许多针对小鼠基因的抗体可供使用。截止到2012年12月6日。来邦网抗体数据库列出的单克隆抗体可以免疫6367种小鼠基因,多克隆抗体可以免疫14937种小鼠基因。(见 抗鼠源基因的抗体)。 所有抗这些基因的抗体可以在来邦网进行搜索比对,例如: 鼠p53, 鼠白蛋白, 鼠cd31, 鼠cd20, 和 鼠c-myc.
抗小鼠抗体的二抗
多数单克隆抗体均生产于小鼠体内,因此抗鼠二抗使用zui为频繁。 来邦网对二抗的调查显示山羊抗鼠二抗是较为普遍的选择。在本网页右侧栏,可见抗鼠不同种型和轻链的二抗的信息链接。
参考文献
Martin R, Brady J, Lew A. The need for IgG2c specific antiserum when isotyping antibodies from C57BL/6 and NOD mice. J Immunol Methods. 1998;212:187-92 PMID 9672206
Michaelsen T, Kolberg J, Aase A, Herstad T, Høiby E. The four mouse IgG isotypes differ extensively in bactericidal and opsonophagocytic activity when reacting with the P1.16 epitope on the outer membrane PorA protein of Neisseria meningitidis. Scand J Immunol. 2004;59:34-9 PMID 14723619